Много фактори могат да нарушат естественото равновесие във влагалището, и ако станат прекалено интензивни, вагиналната флора вече не може да се адаптира, което евентуално би довело до вагинална инфекция. В такива случаи броят на млечнокиселите бактерии във вагината обикновено е намален и рН често се повишава до стойости над 4,5.

Вагиналните оплаквания, като сърбеж, парене и отделяне на секрет, могат да бъдат признаци на бактериална или гъбична инфекция и, съответно, на дисбаланс във вагиналната флора. Тези симптоми са лесно видими.
Като използват продукти с млечна киселина, жените, които са податливи на чести вагинални инфекции, могат да възстановят и поддържат здрава влагалищна среда и по този начин да спомогнат за предотвратяване на вагинални инфекции (вижте Vagisan Млечна киселина)